Собственная скважина на участке

Хотим пробурить скважину во дворе частного дома. Нужны ли для этого какие-либо согласования? Нужно ли ставить счетчик на воду? Как платить?
Нет, согласование и счетчик ставить не нужно. Платить тоже никому не нужно, только за установку буровой скважины (если бурите скважину при помощи сторонних организаций).
Есть несколько моментов, которые необходимо учитывать в целях соблюдения законодательства:

пользование водой из скважины должно быть сугубо для собственных нужд – жизнеобеспечение, удовлетворение садовых и бытовых потребностей к примеру. Использование скважины в целях осуществления предпринимательской деятельности запрещено;
добываемый объем воды из скважины не должен превышать сто кубических метров в сутки;
эксплуатировать можно только первый от поверхности водоносный горизонт.
Само собой, у собственников скважин есть и ответственность. Так, согласно закону Московской области от 18.07.2015 № 125/2015-ОЗ, обладатели скважины должны:

соблюдать требования законодательства Российской Федерации о недрах, об охране окружающей среды, об особо охраняемых природных территориях, земельного, лесного и водного законодательства, санитарно-эпидемиологических требований;
обеспечивать безопасное ведение работ, связанных с использованием общераспространенных полезных ископаемых, подземных вод, строительством подземных сооружений;
не допускать негативного воздействия на территорию, прилегающую к земельному участку;
обеспечить приведение земельных участков и других природных объектов, нарушенных при пользовании недрами, в состояние, пригодное для их дальнейшего использования.